وحال الموت بينه وبين إتمامه. ومما وضعه: المخطوطات العربية في مكتبتنا الشرقية (المشرق، 7، 1904، 8، 1905، 9، 1906) ومخطوطات القديس يوحنا فم الذهب (المشرق، 12، 1909) ومن بيروت إلى الهند في طلب المخطوطات (المشرق، 15، 1912، و 16، 1913) والمخطوطات العربية لكتبة النصرانية (المشرق 20، 1922، 21، 1923، 22، 1924) وفهرس مخطوطات المكتبة الشرقية، وضع له الأب توتل جداول عامة بالعربية (منوعات الكلية الشرقية، 6، 1913، 7، 1921، 8، 1922، ومنوعات جامعة القديس يوسف، 10، 1925، 11، 1926، 14، 1930، ثم في كتاب مستقل، في 531 صفحة) ووضع الأب توتل ملحقاً له بعنوان: بعض المخطوطات العربية التي دخلت المكتبة الشرقية (المشرق، 39، 1941) ووضع الأب كولنجيت: فهرس مخطوطات علم الفلك فيها (المشرق 3، 1900) وفهرس المخطوطات الطبية (المشرق، 4، 1901).
ويتناول فهرس المخطوطات في المكتبة الشرقية: المخطوطات المسيحية 1 - 66، والإسلامية التاريخيه 67 - 163، والجغرافية 164 - 186 وعلم الفلك 187 - 215، والطبيعة والموسيقى والحيل 216 - 225، والرياضيات 226 - 245، والمعادن والكيميا والعرافة 246 - 278، والطب 279 - 336، والفلسفة 337 - 418، والكتاب المقدس 419 - 467، ودراسة عقيدة آباء الكنيسة 468 - 513، والمجامع الكنسية 514 - 538، والكتاب الإكليريكيين منذ القرن الحادي عشر إلى القرن السادس عشر 539 - 591، وسير القديسين وآثارهم 592 - 661، وجدل 662 - 792.
والمكتبة على صلة بالمكتبات الشرقية في العالم تتلقى منها 250 نشرة دورية ومجلة في السنة، عدا المصنفات التي يهديها إليها الأفراد، والمؤسسات، والحكومات.
المكتبة العربية السكولاستيكية La رضي الله عنهibliotheca صلى الله عليه وسلمrabica Scholasticorums النشر نصوص الفلسفة العربية (التي ترجمت إلى اللاتينية في مجمع ترانت) بتحقيق وترجمة على غاية من الدقة. ولم يأل الأب بويج مؤسسها جهدا في تحقيق النصوص في مكتبات القاهرة، وباريس، ولندن، وشمالي أفريقيا وغيرها، لوضع مادة