توفي «عبد الباقي» بالاسكندرية، وقيل بمصر، بعد سنة ثمانين وثلاثمائة، بعد حياة حافلة بتعليم القرآن الكريم.
رحمه الله رحمة واسعة، وجزاه الله أفضل الجزاء.