هو محمد بن علي بن أبي علي الحسن بن أبي الحسين محمد بن أبي عبد الله الحسين جوهرك ابن محمد بن يحيى النقيب ابن محمد بن أحمد زبارة ابن محمد بن عبد الله المفقود ابن الحسن المكفوف ابن الحسن الأفطس ابن علي الأصغر بن علي بن الحسين بن علي بن أبي طالب رضي الله عنهم.
العقب منه في أبي طالب.
نسب ابن عم أبيه هو: السيد أبو البركات محمد بن أبي الحسين محمد بن الحسين جوهرك ابن محمد النقيب ابن يحيى بن محمد بن أحمد زبارة ابن محمد بن عبد الله المفقود ابن الحسن المكفوف ابن الحسن الأفطس ابن علي الأصغر بن علي بن الحسين بن علي بن أبي طالب رضي الله عنهم.
أبو هاشم محمد بن الحسين بن محمد بن عبد الله بن محمد بن علي بن عبد الله بن الحسين بن محمد بن عبد الله الأشتر بن محمد النفس الزكية ابن عبد الله بن الحسن بن الحسن بن علي بن أبي طالب رضي الله عنهما.
العقب من أبي هاشم: في أبي الفضل، وشرف شاه.
هو السيد أبو بكر بن محمد بن علي بن أبي طالب بن محمد بن جعفر بن محمد بن عبد الله بن الحسن المثلث ابن الحسن بن الحسن بن علي بن أبي طالب رضي الله عنهما.
السيد الحسين بن الحسن بن علي بن الحسين بن محمد بن الحسين بن علي بن محمد بن عيسى المكري.
وببلخ إبراهيم والقاسم وجعفر وحمزة أبناء علي بن حمزة بن إسماعيل بن أحمد بن محمد بن عيسى المكري، وهو أبو تراب بن محمد بن القاسم بن الحسن بن زيد بن الحسن بن علي بن أبي طالب رضي الله عنهما.
أبو بكر بن عمر بن يحيى بن محمد بن الحسن بن عبيد الله بن جعفر بن محمد بن إبراهيم بن محمد اليماني بن عبيد الله بن موسى بن جعفر الصادق رضي الله عنهما.
أشرت إلى نسبه عند نسب السيد أبي القاسم العريضي، وهو: كمال الدين أبو جعفر محمد بن حمزة بن علي بن عيسى بن علي بن الحسن بن عيسى بن محمد بن علي العريضي.
وقد رأيته في شهور سنة ثلاث عشر وخمسمائة بنيسابور. وقطب الدين جعفر، وأقاربه الحسن بن عيسى بن محمد بن حمزة.
قال: أنا علي بن خليفة بن محمد بن الحسن بن الحسن بن أحمد بن علي بن الحسن الشجري ابن علي بن عمر بن علي بن الحسين بن علي بن أبي طالب رضي الله عنهم.
مات السيد المتكلم أبو الحسن الشجري يوم الأحد السادس والعشرين من محرم أربع وخمسين وخمسمائة.
العقب منه في علي الأكبر وعلي الأصغر المعروف بعلي بن أبي طالب وعلي الرضا، وخليفة.
والعقب من علي الأكبر: أبو المعالي، وخليفة. وأبو المعالي ربع كث اللحية أملح على خده اليمنى خال وبشفه الأيمن جدر، ومات علي الأكبر في شهور سنة ثمان وأربعين وخمسمائة.
أبو عبد الله الحسين والمنتهى وسمية وفاطمة وخديجة أولاد السيد حيدر ابن الحسن بن محمد بن أبي عبد الله بن علي بن محمد بن الحسين بن محمد بن الحسن بن زيد المظلوم ابن زين العابدين علي بن الحسين بن علي بن أبي طالب رضي الله عنهم.
هم من أولاد أبي محمد إسماعيل بن جعفر بن أحمد بن جعفر بن القاسم بن محمد بن زيد بن علي بن الحسين بن علي بن أبي طالب رضي الله عنه.
هو أبو البركات بن أبي الحسن محمد بن الحسين بن علي بن محمد بن عبد الله بن علي بن علي بن الحسن بن الحسين بن جعفر الحجة ابن عبيد الله الأعرج ابن الحسين الأصغر بن علي بن الحسين زين العابدين رضي الله عنهما.
إخوانه أبو الحسن طاهر، وأبو علي، والحسن، وأبو إبراهيم، وعلي، ومحمد، وأبو القاسم. أبو علي درج.
العقب من أبي القاسم: في أبي عبد الله. والعقب من محمد: في المرتضى.