2- شرح مقامات بديع الزمان الهمزاني:
احتفل الإمام بهذا الكتاب، فوضع غامضة وفسر مبهمة، وأخرجه للناس جم النفع قريب الفائدة، وهو مطبوع في بيروت "1306هـ-1889م"، ولم يعرف لغيره شرح لهذه المقامات.
3- رسالة الرد على الدهريين:
كتبها بالفارسية "السيد جمال الدين الأفغاني"، ثم ترجمها الإمام إلى العربية بمساعدة "عارف أفندي أبي تواب" أحد أصدقائه من الأفغانيين، وقد طبعت للمرة الأولى في بيروت سنة 1313هـ -وطبعت للمرة الثانية في القاهرة "1312هـ-1895م"، ثم تكرر طبعها وكان آخره سنة 1344هـ-1925م.
4- الإسلام والرد على منتقديه:
وهو سلسلة مقالات نشرها في صحيفة "المؤيد" سنة 1900 يرد بها على "المسيو هانوتو"، أحد وزراء خارجية فرنسا السابقين التي نشرها في صحيفة "دي باري"، وقد ترجمها إلى الفرنسية، وطبعة مرة ثانية بالعربية بعد أن أضيفت إليها مقالات أخرى للإمام، وذلك في سنة 1327هـ 1909م، وطبعت غير مرة، وكان آخر طبعها في سنة 1343هـ 1924م.
5- الإسلام والنصرانية:
مجموعة مقالات ظهرت في "الأهرام" سنة 1901ردا على ما كان يكتبه "فرج أنطون" في مجلة الجامعة، ثم طبعت في القاهرة "1320هـ 1902م"، وصدرت الطبعة الثالثة سنة "1341هـ-1922م".
6- تاريخ إسماعيل باشا:
لم نر هذا الكتاب، ولكن "السيد رشيد رضا" الذي لم يره أيضا يذكر