4 - أسرار الكيمياء
نشرت في Paris 1892؛
5 - الإيضاح - في الكيمياء
آستان قدس رضوي 10739، 1226 هـ؛ رقم 10748 , 1296 هـ؛ المكتبة الخديوية 6234/ 2؛ نشر في 1928 Paris؛
7 - تدبير الإكسير الأعظم
نشر في دمشق 1988 فيه أربع عشرة رسالة في صنعة الكيمياء؛
8 - تفسير كتاب الإسطقصاآت
نشر في Paris 1928 وفي رضي الله عنهombay طبعة حجر بدون تاريخ؛
9 - جنات الخلد - في الكيمياء
آستان قدس رضوي 10795؛ 1266 هـ؛
10 - الحاصل في الكيمياء
جامعة الرياض 7570 ورقة 3؛
11 - الخواصّ الصغيرة - في الكيمياء
آية الله نجفي 3634 , ورقة 82؛ 1107 هـ؛
12 - الخواصّ الكبيرة= المقالات الكبرى= الرسائل السبعية= الجامع - في الكيمياء
وهبي أفندي 2280؛ ولي الدين أفندي 2564؛ بلدية الإسكندرية 45204/ج ورقة 161 كتبت في القرن 13 هـ؛ آستان قدس رضوي رقم 10798، 1278 هـ؛ رقم 10680؛
13 - خواص سور القرآنية
أحمد ثالث 132 ورقة 13 - 27؛
14 - الرحمة الصغير لجابر؛
الظاهريّة عام 9649 ورقة 67 - 70؛ 1048 هـ؛
15 - رسائل في العلوم الكيماوية والصنعية
نشرت في Paris 1893؛
16 - رسائل جابر بن حيان - في الكيمياء
آستان قدس رضوي 11048 , 1267 هـ؛
17 - رسالة في الجفر - في الخواص
جار الله أفندي 895؛ مشهد 5269؛
18 - رسالة في موازين علم الكاف
الظاهريّة عام 10102 ورقة 34؛
19 - رسالة في تدبير الحجر الكريم - في الكيمياء
القاهرة ملحق مجموعة 3735/ ك ورقة 57 - 58؛ رقم 14/ ش لوحة 113 - 115 نسخة مصوّرة، رقم 15/ ش نسخة مصورة؛ دار الكتب المصريّة 3735/ك؛ آستان قدس رضوي رقم 11003؛ حسن حسني عبد الوهّاب بتونس 18032/ 4 ورقة 48 - 50؛ آية الله نجفي 1414/ 1 ورقة 7، 1265 هـ؛ نشرت في Paris 1928 وفي رضي الله عنهombay طبعة حجر بدون تاريخ؛
20 - رياض الأكبر - في الكيمياء
آستان قدس رضوي رقم 5768؛
21 - سر السار وسرّ الأسرار - في الكيمياء
شهيد علي رقم 1749/ 5؛ آستان قدس رضوي 12204 ,1207 هـ؛ رقم 10799؛
23 - شرح كتاب الرحمة - في الكيمياء
جار الله أفندي رقم 1641؛
24 - شرح مصححات أفلاطون
القاهرة ملحق 96/ ش ورقة 80 - 1306 هـ؛ رقم 106/ ش ورقة 180 , 1364 هـ؛ دار الكتب المصريّة رقم 96/ ش؛
25 - الصافي - في الكيمياء
آية الله نجفي 3386/ 6 ورقة 99 - 127، 1268 هـ؛ آستان قدس رضوي 10795 ,1276 هـ؛
26 - صنعة الماء المرّ من الماه المعروف بـ (المرّ) = صنعة ماء الكبريت وصنعة الماء السريع
نشرت في أوربا 1939؛
27 - الطبيعة الخامسة - في الفلسفة
آية الله نجفي 3386/ 12 ورقة 227 - 235، 1268 هـ؛
28 - علم الكتف (الكاف) والخواصّ في الطب
ملّي كتبخانه 4441 صلى الله عليه وسلم ورقة 56؛ 1198 هـ؛