آية الله نجفي 4677/ 3 ورقة 159 - 172، 1076 هـ؛
30 - حاشية على شرح العقائد
المكتبة القادريّة 1422/ 2 ورقة 169 - 232؛
31 - حاشية على عين اليقين للفيض كاشاني
تاريخ التأليف 1136 هـ؛ مسجد أعظم ورقة 200 قيد التملّك 1180 هـ؛
32 - حاشية على الصحيفة السجادية - في الأدعية
تاريخ التأليف 1054 هـ؛ آية الله نجفي رقم 5365 ورقة 54، 1065 هـ؛ رقم 1363، آستان قدس رضوي رقم 6998، 1097 هـ؛ رقم 3382؛
33 - الحقائق في أسرار الدين ومكارم الأخلاق
تاريخ التأليف 1091 هـ، بانكبور خدابخش رقم 2748 ورقة 130، 1100 هـ؛ مدرسة غرب همدان 258؛ 468، 1147 هـ؛ مكتبة الأوقاف العامّة 7011/ 2 ورقة 112؛ 1239 هـ؛ مسجد أعظم 2723 كتب في القرن 11 هـ؛ رقم 1195/ 1، 1237 هـ، ؛ آية الله نجفي رقم 1233 ورقة 124، 1135 هـ؛ آستان قدس رضوي رقم 3525، 1176 هـ؛ رقم 5995، 1177 هـ؛ رقم 6436، 1262 هـ؛ رقم 3462، 1197 هـ؛ رقم 6436، 1262 هـ؛ رقم 3462، 8146؛ طبعت في طهران 1299، 1378 وفي رقم 1409؛
34 - حدوث العالم - في الكلام
آستان قدس رضوي رقم 5900، 1266 هـ؛
35 - خلاصة الأذكار وإطمينان القلوب
مسجد أعظم 2611، 1124 هـ؛ رقم 3009/ 2، 1139 هـ؛ آية الله نجفي رقم 4677/ 2 ورقة 43 - 158، 1076 هـ؛ رضوي رقم 10643، 1238 هـ؛ رقم 3145، 3341؛ 15281، 1103 هـ؛
36 - خلاصة الأصول (منظوم)
آستان قدس رضوي رقم 6531، 1257 هـ؛ رقم 14332، 1261 هـ؛ رقم 7205، 2957؛
37 - دفع آفات ورفع بليات - في الأدعية (ف)
مسجد أعظم 3395/ 1 ورقة 25؛ آية الله نجفي رقم 4365، ورقة 87 كتبت في القرن 12 هـ، رقم 25؛ رقم 5290/ 17 ورقة 225 - 226، 1116 هـ؛ رضوي رقم 115023، 1153 هـ؛
38 - ديوان فيض كاشاني (ف)
آية الله نجفي رقم 4134 ورقة 231، 1210 هـ؛ نشر في رضي الله عنهombay 1300، وفي طهران 1300، 1348، 1357
39 - ذريعة الضراعة - في الأدعية والأوراد
تاريخ التأليف 1051 هـ، آية الله نجفي رقم 598 ورقة 171، 1089 هـ؛ رقم 2840 ورقة 195، 1241 هـ، مدرسة غرب همدان رقم 129؛ 15311؛
40 - راه صواب - في الجواب عن أسئلة (ف)
آية الله نجفي رقم 686/ 1 ورقة 2 - 12؛
41 - رسالة في نفي الجبر والتفويض - في الكلام
آستان قدس رضوي رقم 644، 1263 هـ؛
42 - رسالة في كيفية علم الله تعالى
مدرسة غرب همدان 188/ 5؛
43 - رسالة في القضاء والقدر - في الكلام
آستان قدس رضوي رقم 627، 1300 هـ؛
45 - رسالة في الحدوث والعدم - في الكلام
مدرسة غرب همدان رقم 646/ 5 صفحة 177 - 193، 1221 هـ؛
46 - رسالة في وحدة وجود الواجب تعالى
آستان قدس رضوي رقم 5964؛
47 - رفع الفتنة - في الأخلاق (ف)
آية الله نجفي رقم 82/ 7 ورقة 53 - 62؛
48 - زاد السالك - في الأخلاق (ف)
آية الله نجفي رقم 82/ 2 ورقة 11 - 18؛ رقم 1430/ 2 ورقة 7 - 11، 1222 هـ؛ مسجد أعظم 718/ 2 كتب في القرن 13 هـ؛ رقم 3488/ 4، 1249 هـ؛ رقم 3877/ 3؛