أما المكتبات العلمية، فقد وجد منها بهذا العصر عدد كبير ملحق بالمدارس التى أنشئت فى عصر المماليك، ومن قبلهم، ومنها:
(1) "المكتبة الظاهرية": وهى التى ألحقها الظاهر بيبرس بمدرسته بخط بين القصرين سنة 662 هـ (1263 م)، وقد اشتملت على أمهات الكتب فى شتى العلوم (?).
(2) "المكتبة المنصورية": وهى التى بناها المنصور قلاوون بمدرسته المنصورية التى أسسها سنة 688 هـ بخط بين القصرين، وقد أمدها السلطان بالمصاحف وكتب الفقه والتفسير والحديث وجميع الفنون (?).
(3) "المكتبة الناصرية": وهى التى ألحقها الناصر محمد بن قلاوون بمدرسته الناصرية (?).
(4) "المكتبة التنكوتمرية": وهى التى أنشأها تنكوتمر بمدرسته التى شيدها سنة 698 هـ (1298 م) (?).
(5) "المكتبة الطيبرسية": وهى التى أنشأها الأمير علاء الدين بن طيبرس الخازندار، نقيب الجيوش، بمدرسته الطيبرسية التى أنشأها سنة 709 هـ (1309 م) (?).
(6) مكتبة سيف الدين آل ملك الجوكندار الناصرى: وكانت تجاه داره بخط المشهد الحسينى (?).
(7) "مكتبة خوند بركة": أم السلطان شعبان التى ألحقتها بمدرستها التى