والباحث يؤكد على أن خادم الحرمين الشريفين وحكومته والعاملين في الجامعة الإسلامية قد أخذوا على عاتقهم القيام بتطبيق القرارات الصادرة من المجلس الأعلى، وعلى سبيل المثال أُنشئت عمادة الدراسات العليا، وظهرت اللوائح والأنظمة الجديدة للجامعة في كثير من كلياتها وجهاتها التعليمية.
المبحث الثاني: دورات المجلس الأعلى للجامعة الإسلامية
أولاً - الدورات التي ترأسها خادم الحرمين الشريفين حفظه الله:
بلغ عدد دورات المجلس الأعلى للجامعة الإسلامية خمس عشرة دورة، كان خادم الحرمين الشريفين يحرص شخصياً على رئاستها وإن تعذر حضوره أناب من يقوم مقامه من كبار مسؤولي الدولة. من الدورات التي ترأسها حفظه الله ما يلي:
الدورة الأولى:
وقد افتتح حفظه الله هذه الدورة للمجلس الأعلى للجامعة عندما كان ولياً للعهد، ونائباً لرئيس مجلس الوزراء، والرئيس الأعلى للجامعة الإسلامية، وكان ذلك بمقر الجامعة وعقدت في الفترة من 17 - 19/3/1396هـ.
الدورة الرابعة:
وقد شرف صاحب السمو الملكي الأمير فهد بن عبد العزيز ولي العهد ورئيس مجلس الوزراء والرئيس الأعلى للجامعة افتتاح الدورة الرابعة المنعقدة في الفترة من 16 إلى 18 من رجب عام 1397هـ.
الدورة العاشرة:
في يوم الأحد 5 من ذي القعدة عام 1400هـ رأس حضرة صاحب السمو الملكي الأمير فهد بن عبد العزيز ولي العهد ونائب رئيس الوزراء والرئيس الأعلى للجامعة، الدورة العاشرة للمجلس الأعلى.
الدورة الخامسة عشرة:
هي الدورة الوحيدة التي ترأسها وهو ملك للبلاد حفظه الله. في 22/2/1407هـ عقدت الدورة الخامسة عشرة والأخيرة برئاسة خادم
الحرمين الشريفين الملك فهد بن عبد العزيز الرئيس الأعلى للجامعة.
وقد تفضل - حفظه الله - بإلقاء كلمات في كل دورة ترأسها وفي الفصل الثالث تحليل تربوي لها.
ثانياً- الدورات التي أناب فيها خادم الحرمين الشريفين لرئاسة المجلس الأعلى للجامعة الإسلامية: