يشتمل فهرس الآيات القرآنية على الآيات الواردة في هذا الكتاب وأرقامها في سورها، مضبوطة بالشكل ضبطا كاملا (برواية حفص)، وتم ترتيبها بحسب كل مجلد من مجلدات اللوامع، وحسب صفحاته، وقد بلغ عددها 1183 آية موزعة في الكتاب على نحو ما هو مبين في الجدول 4:
الجدول رقم 4 توزع الآيات القرآنية الواردة في الكتاب حسب المجلدات
المجلد - عدد الآيات - المجلد - عدد الآيات
الأول - 216 - الثامن - 20
الثاني - 162 - التاسع - 45
الثالث - 116 - العاشر - 51
الرابع - 107 - الحادي عشر - 34
الخامس - 132 - الثاني عشر - 47
السادس - 59 - الثالث عشر - 66
السابع - 89 - الرابع عشر - 39
مجموع الآيات - 1183