كتاب المراسيل: وهو أحد أجزاء السنن الثمانية عشرة، وقد أفرده العلماء بجزء مستقل، ذكر فيه أبو داود ما يروى عَنِ النَّبِيِّ صَلَّى اللَّهُ عَلَيْهِ وسلم من المراسيل، منها ما لا يصح ومنها، ما يسند عند غيره وهو متصل صحيح1.

كتاب مسائل أبي داود للإمام أحمد في الرواة2: وقد رتبه على البلدان3.

كتاب مسائل أبي داود للإمام أحمد في الفقه4.

كتاب السؤالات، الذي بين أيدينا من جمع تلميذه الآجري.

كتاب البعث والنشور5.

كتاب تسمية الإخوة الذين روي عنهم الحديث6.

الناسخ والمنسوخ7.

مسند مالك8.

دلائل النبوة9.

كتاب أصحاب الشعبي10.

كتاب الرد على أهل القدر11.

وله مصنفات أخرى تدل على غزارة علمه في مختلف العلوم.