- تم عمل الفهارس الآتية:

1 - فهرس الأرباع.

2 - القراءات المتواترة غير حفص.

3 - القراءات الشاذة.

4 - الأحاديث القولية.

5 - الأحاديث الفعلية.

6 - الآثار.

7 - رجال الإسناد.

8 - الأعلام المترجم لهم غير رجال الإسناد.

9 - فهرس شيوخ المصنف.

10 - الفرق والأديان.

11 - الشعر.

12 - الألفاظ المشروحة لغويًا.

13 - موضوعات القرآن الكريم (وهو مستفاد من كتاب: دليل الموضوعات في آيات القرآن الكريم).

14 - فهرس المصادر والمراجع.

15 - فهرس ترتيب الكتاب ببيان موضع بداية السور والأجزاء والأرباع.