الآية الرابعة: قوله تعالى: * (ومن يضلل الله فما له من هاد ... ) * الآية [22، 36 / الزمر / 39] نسخ معناها بآية السيف.
الآية الخامسة: قوله تعالى: * (قل يا قوم اعملوا على مكانتكم ... ) * الآية [39 / الزمر / 39] نسخت بآية السيف.
الآية السادسة: قوله تعالى: * (أنت تحكم بين عبادك فيما كانوا فيه نختلفون) * الآية [46 / الزمر / 39] نسخ معناها بآية السيف.
الآية السابعة: قوله تعالى: * (فمن اهتدى فلنفسه ومن ضل فإنما يضل عليها) * الآية [15 / الإسراء / 17] نسخها الله عز وجل بآية السيف.
40 - سورة المؤمن: مكية وجميعها محكم غير آيتين:
أولاهما قوله تعالى: * (فاصبر إن وعد الله حق ... ) * الآية [55 غافر / 40] نسخ الأمر بالصبر بآية السيف.
الآية الثانية: قوله تعالى: * (فاصبر إن وعد الله حق فإما نرينك بعض الذي نعدهم ... ) * [77 / غافر / 40] نسخت أيضا بآية السيف.
41 - سورة فصلت: مكية، وجميعها محكم غير آية واحدة وهي قوله تعالى: * (ولا تستوي الحسنة ولا السيئة ... ) * الآية [34 / فصلت / 41] نسخت بآية السيف.
42 - سورة الشورى: مكية، وجميعها محكم غير ثماني آيات:
أولاهن: قوله تعالى: * (يسبحون تحمد ربهم ويستغفرون لمن في الأرض ... ) * الآية [15 / الشورى / 42]