3- الحقبة الثالثة (1982-2003م) :
وتمتاز هذه الحقبة بتحويل المعاهد العليا للعلوم الإسلامية إلى كليات الإلهيات بموجب قانون مجلس التعليم العالي الذى صدر عام 1982م. وفي هذه الحقبة افتتحت كليات إلهيات جديدة في مدن مختلفة: كأورفة (1987م) ، وإصطنبول، وسيواس، وملطية (1992م) ، ووان، وريزة، وجوروم، ودياربكر، وأضنة، وإسبرطة، وأدابازاري (1993م) ، وألازيغ (1994م) ، وشاناق قلعة، وأسكي شهير (1995م) ، وقهرمان مرعش (1996م) . فبلغ عدد هذه الكليات 23 كلية. وبسبب ازدياد عدد الكليات ارتفع مستوى التعليم مما جعل الحاجة تشتد إلى أساتذة وإدارة أكاديمية ومصادر علمية. فتمخض كل هذا عن تطور علمي؛ فكثرت البحوث العلمية في العلوم الشرعية في هذه الفترة فبلغ عدد رسائل الماجستير حوالى 500 رسالة، وعدد رسائل الدكتوراه حوالى 200، أما بحوث القبول في هيئة التعليم وبحوث الأستاذ المساعد وبحوث الترقية لنيل درجة الأستاذ