ومن مصنفاته:
لابن عقيل مصنفات كثيرة في أصول الدين والفقه والفروع والزهد وغير ذلك، فمنها:
- أحاديث سئل عنها فأجاب.
- الإرشاد في أصول الدين.
- الإشارة، وهو اختصار لكتاب الروايتين والوجهين له.
- الانتصار لأهل الحديث.
- التذكرة في أصول الفقه.
- تفضيل العبادات على نعيم الجنات.
- تهذيب النفس.
- الجدل في الفقه
- جزء في الأصول.
- المناظرات.
- المنثور.
- نفي التشبيه.
- الواضح في أصول الفقه. (?) وغيرهم كثير.