1. ديوان شعري: جمع ابنه عقيل توجد نسخة منه في مكتبة الاحقاف للمخطوطات بتريم وتحمل عنوان «الكلام المنظوم للحبيب العلامة عبد الله بن عمر بن يحيى». (مخ: 2623). (?)
2. أسئلة حول من يذكرون الله قياماً وقعوداً وبأنغام الموسيقى: تقع في ست وأربعين ورقة (مخ: 2821).
3. السيف البتار فيمن يوالي الكفار ويجلب الحوائج إليهم: رسالة تقع في ثلاث أوراق.
4. خبر أهل الكساء: يقع في ثلاث أوراق.
5. تذكرة إخواننا الحجاج بسكان سربايا: تقع في ثلاث أوراق (مخ: 2821).