رتَب المؤلف كتابَه على ثلاثة عشر بابًا:
1 - في انقسام القلوب إلى صحيح وسقيم وميت.
2 - في ذكر حقيقة مرض القلب.
3 - في انقسام أدوية أمراض القلب إلى طبيعية وشرعية.
4 - في أن حياة القلب وإشراقه مادة كل خير فيه، وموته وظلمته مادة كل شر وفتنة فيه.
5 - في أن حياة القلب وصحته لا تحصل إلّا بأن يكون مدركًا للحق مريدًا له مُؤثِرًا له على غيره.
6 - في أنه لا سعادة للقلب ولا لذة ولا نعيم ولا صلاح إلّا بأن يكون إلهه هو معبوده وأحبَّ إليه من كل ما سواه.
7 - في أن القرآن الكريم متضمن لأدوية القلب وعلاجه من جميع أمراضه.
8 - في زكاة القلب.
9 - فىِ طهارة القلب من أدرانه وأنجاسه.
10 - في علامات مرض القلب وصحته.
11 - في علاج مرض القلب من استيلاء النفس عليه.
12 - في علاج مرض القلب بالشيطان.
13 - في مكايد الشيطان التىِ يكيد بها ابنَ آدم.